Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rom1P32958 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rom1P32958 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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