Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms