Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtgfP29268 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtgfP29268 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtgfP29268 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtgfP29268 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms