Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif5cP28738 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif5cP28738 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms