Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NapbP28663 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NapbP28663 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NapbP28663 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NapbP28663 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NapbP28663 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NapbP28663 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NapbP28663 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NapbP28663 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NapbP28663 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NapbP28663 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NapbP28663 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NapbP28663 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NapbP28663 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NapbP28663 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NapbP28663 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NapbP28663 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NapbP28663 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NapbP28663 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NapbP28663 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NapbP28663 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NapbP28663 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NapbP28663 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NapbP28663 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NapbP28663 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NapbP28663 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NapbP28663 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NapbP28663 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NapbP28663 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NapbP28663 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NapbP28663 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NapbP28663 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NapbP28663 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NapbP28663 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NapbP28663 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NapbP28663 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NapbP28663 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NapbP28663 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NapbP28663 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NapbP28663 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NapbP28663 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NapbP28663 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NapbP28663 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NapbP28663 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NapbP28663 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NapbP28663 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NapbP28663 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NapbP28663 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NapbP28663 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NapbP28663 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NapbP28663 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NapbP28663 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NapbP28663 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NapbP28663 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NapbP28663 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NapbP28663 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NapbP28663 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NapbP28663 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NapbP28663 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NapbP28663 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NapbP28663 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NapbP28663 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NapbP28663 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NapbP28663 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NapbP28663 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NapbP28663 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NapbP28663 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NapbP28663 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NapbP28663 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NapbP28663 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NapbP28663 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NapbP28663 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NapbP28663 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NapbP28663 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NapbP28663 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NapbP28663 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NapbP28663 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms