Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra3P26049 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms