Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf1bP25119 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms