Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms