Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms