Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tsta3P23591 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms