Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PparaP23204 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PparaP23204 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PparaP23204 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PparaP23204 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PparaP23204 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PparaP23204 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PparaP23204 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PparaP23204 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PparaP23204 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PparaP23204 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PparaP23204 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PparaP23204 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PparaP23204 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PparaP23204 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PparaP23204 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PparaP23204 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PparaP23204 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PparaP23204 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PparaP23204 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PparaP23204 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PparaP23204 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PparaP23204 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PparaP23204 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PparaP23204 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PparaP23204 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PparaP23204 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PparaP23204 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PparaP23204 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PparaP23204 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PparaP23204 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PparaP23204 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PparaP23204 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PparaP23204 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PparaP23204 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PparaP23204 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PparaP23204 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PparaP23204 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PparaP23204 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PparaP23204 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PparaP23204 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PparaP23204 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms