Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3aP23116 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms