Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk1P22518 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk1P22518 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms