Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tap1P21958 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tap1P21958 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tap1P21958 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms