Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms