Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps6ka3P18654 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka3P18654 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms