Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka1P18653 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms