Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpraP18052 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpraP18052 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpraP18052 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpraP18052 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms