Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rag1P15919 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rag1P15919 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rag1P15919 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms