Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SptbP15508 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SptbP15508 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SptbP15508 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SptbP15508 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SptbP15508 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SptbP15508 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SptbP15508 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SptbP15508 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SptbP15508 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SptbP15508 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SptbP15508 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SptbP15508 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SptbP15508 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SptbP15508 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SptbP15508 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SptbP15508 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SptbP15508 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SptbP15508 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SptbP15508 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SptbP15508 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SptbP15508 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SptbP15508 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SptbP15508 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SptbP15508 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SptbP15508 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SptbP15508 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SptbP15508 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SptbP15508 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SptbP15508 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SptbP15508 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SptbP15508 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SptbP15508 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SptbP15508 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SptbP15508 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SptbP15508 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SptbP15508 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SptbP15508 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SptbP15508 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SptbP15508 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms