Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf1P15314 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf1P15314 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms