Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnmt1P13864 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms