Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms