Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb1P12658 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb1P12658 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb1P12658 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb1P12658 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calb1P12658 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms