Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrm1P12657 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms