Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms