Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Ndufb1P0DN34 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Ndufb1P0DN34 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Ndufb1P0DN34 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Ndufb1P0DN34 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ndufb1P0DN34 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ndufb1P0DN34 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ndufb1P0DN34 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ndufb1P0DN34 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ndufb1P0DN34 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ndufb1P0DN34 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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