Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms