Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TnfP06804 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TnfP06804 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnfP06804 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TnfP06804 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TnfP06804 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TnfP06804 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TnfP06804 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TnfP06804 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TnfP06804 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TnfP06804 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TnfP06804 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TnfP06804 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TnfP06804 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TnfP06804 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TnfP06804 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TnfP06804 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TnfP06804 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TnfP06804 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TnfP06804 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TnfP06804 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TnfP06804 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TnfP06804 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TnfP06804 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TnfP06804 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TnfP06804 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TnfP06804 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TnfP06804 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TnfP06804 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TnfP06804 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnfP06804 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms