Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf3P05524 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf3P05524 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms