Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04213 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04213 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P04213 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P04213 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P04213 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P04213 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P04213 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P04213 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
P04213 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P04213 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04213 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04213 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04213 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P04213 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04213 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04213 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04213 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P04213 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04213 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04213 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04213 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04213 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04213 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04213 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P04213 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04213 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms