Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tk1P04184 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tk1P04184 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tk1P04184 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tk1P04184 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tk1P04184 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tk1P04184 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tk1P04184 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tk1P04184 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tk1P04184 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tk1P04184 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tk1P04184 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms