Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd1P03888 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms