Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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HbaP01942 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HbaP01942 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HbaP01942 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HbaP01942 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HbaP01942 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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HbaP01942 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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HbaP01942 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HbaP01942 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HbaP01942 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HbaP01942 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HbaP01942 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HbaP01942 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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HbaP01942 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HbaP01942 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HbaP01942 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HbaP01942 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HbaP01942 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HbaP01942 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HbaP01942 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HbaP01942 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HbaP01942 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HbaP01942 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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HbaP01942 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HbaP01942 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HbaP01942 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HbaP01942 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HbaP01942 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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HbaP01942 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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HbaP01942 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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HbaP01942 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HbaP01942 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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HbaP01942 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HbaP01942 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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HbaP01942 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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HbaP01942 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HbaP01942 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HbaP01942 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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HbaP01942 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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HbaP01942 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HbaP01942 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HbaP01942 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HbaP01942 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HbaP01942 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HbaP01942 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HbaP01942 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HbaP01942 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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HbaP01942 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HbaP01942 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HbaP01942 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HbaP01942 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HbaP01942 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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HbaP01942 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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HbaP01942 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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