Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01680 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01680 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01680 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01680 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01680 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01680 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01680 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01680 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01680 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01680 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01680 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01680 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01680 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01680 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01680 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01680 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01680 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01680 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01680 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01680 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms