Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01662 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01662 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01662 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01662 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01662 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01662 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01662 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01662 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01662 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01662 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01662 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01662 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01662 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01662 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01662 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01662 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01662 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01662 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01662 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01662 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01662 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01662 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01662 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms