Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01661 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01661 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01661 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01661 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01661 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01661 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01661 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01661 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01661 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01661 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01661 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01661 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01661 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01661 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01661 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01661 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01661 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01661 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01661 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01661 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01661 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01661 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01661 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01661 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01661 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01661 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01661 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01661 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01661 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01661 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01661 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01661 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01661 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01661 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01661 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms