Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc6O88978 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc6O88978 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc6O88978 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc6O88978 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc6O88978 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc6O88978 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc6O88978 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc6O88978 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc6O88978 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc6O88978 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc6O88978 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc6O88978 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc6O88978 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc6O88978 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms