Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tom1O88746 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tom1O88746 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tom1O88746 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tom1O88746 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tom1O88746 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tom1O88746 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tom1O88746 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tom1O88746 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tom1O88746 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tom1O88746 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tom1O88746 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tom1O88746 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tom1O88746 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tom1O88746 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tom1O88746 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tom1O88746 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms