Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dll3O88516 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dll3O88516 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dll3O88516 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dll3O88516 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dll3O88516 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dll3O88516 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dll3O88516 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dll3O88516 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dll3O88516 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms