Protein–RNA interactions for Protein: O88451

Rdh7, Retinol dehydrogenase 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh7O88451 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh7O88451 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh7O88451 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms