Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkcO88445 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkcO88445 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AurkcO88445 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AurkcO88445 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AurkcO88445 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AurkcO88445 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AurkcO88445 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AurkcO88445 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms