Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AvilO88398 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AvilO88398 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AvilO88398 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AvilO88398 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AvilO88398 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AvilO88398 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AvilO88398 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AvilO88398 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AvilO88398 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AvilO88398 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AvilO88398 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AvilO88398 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AvilO88398 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AvilO88398 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AvilO88398 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AvilO88398 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AvilO88398 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AvilO88398 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AvilO88398 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AvilO88398 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AvilO88398 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AvilO88398 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms