Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a4O88343 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms