Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms