Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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