Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PrxO55103 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PrxO55103 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrxO55103 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrxO55103 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrxO55103 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrxO55103 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PrxO55103 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrxO55103 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrxO55103 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrxO55103 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PrxO55103 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrxO55103 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrxO55103 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrxO55103 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrxO55103 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrxO55103 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrxO55103 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PrxO55103 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrxO55103 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrxO55103 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrxO55103 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrxO55103 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrxO55103 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrxO55103 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrxO55103 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrxO55103 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrxO55103 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrxO55103 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PrxO55103 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrxO55103 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrxO55103 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrxO55103 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrxO55103 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrxO55103 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrxO55103 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrxO55103 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrxO55103 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrxO55103 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrxO55103 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrxO55103 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrxO55103 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PrxO55103 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PrxO55103 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrxO55103 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrxO55103 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PrxO55103 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrxO55103 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrxO55103 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrxO55103 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrxO55103 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrxO55103 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PrxO55103 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrxO55103 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrxO55103 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrxO55103 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrxO55103 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrxO55103 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrxO55103 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrxO55103 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrxO55103 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrxO55103 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrxO55103 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrxO55103 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrxO55103 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrxO55103 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrxO55103 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PrxO55103 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrxO55103 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrxO55103 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PrxO55103 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrxO55103 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrxO55103 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PrxO55103 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrxO55103 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrxO55103 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrxO55103 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrxO55103 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrxO55103 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrxO55103 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrxO55103 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrxO55103 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrxO55103 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrxO55103 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrxO55103 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrxO55103 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrxO55103 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PrxO55103 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrxO55103 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrxO55103 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrxO55103 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrxO55103 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PrxO55103 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms