Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms