Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb2O55029 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb2O55029 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb2O55029 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb2O55029 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb2O55029 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb2O55029 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb2O55029 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb2O55029 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb2O55029 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Copb2O55029 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Copb2O55029 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Copb2O55029 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Copb2O55029 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Copb2O55029 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Copb2O55029 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Copb2O55029 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Copb2O55029 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copb2O55029 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copb2O55029 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copb2O55029 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copb2O55029 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copb2O55029 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Copb2O55029 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms