Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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BckdkO55028 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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BckdkO55028 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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BckdkO55028 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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BckdkO55028 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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BckdkO55028 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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BckdkO55028 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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BckdkO55028 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdkO55028 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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BckdkO55028 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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